以锦南街道横溪源头为名。
南宋咸淳间（1265～1274）属临安县庆仙乡，明代仍之，清乾隆二十四年（1759）深湖、甘山属庆仙二图。
民国初属庆凤乡，民国17年（1928）属庆凤区，民国24年（1935）属甘樟乡，民国30年（1941）深坞里、甘山脚、荷花塘属横溪乡，民国34年（1945）属锦南乡至解放。
1950年为甘樟乡甘樟村，1956年为甘山高级社，1958年为临安公社甘山、甘岭、深湖生产队，1961年为上甘公社甘山、甘岭、深湖生产大队，1984年为上甘乡甘山、甘岭、深湖村，2001年属上甘街道。
2008年1月三村合并为锦南街道锦源村，辖6个自然村。