云仙最先称上北区。
清代时期，属六顺土司辖地。
民国二年（1913年），为思普沿边行政总局第八行政区。
民国十六年（1927年），为六顺县云仙乡。
1949年，为六顺县第三区；同年11月，成立云仙区。
1951年10月，改称第三区。
1953年，六顺县并入思茅县，为思茅县云仙区。
1957年，云仙区改乡。
1958年，思茅县并入普洱县，云仙、震东合并称跃进公社。
1961年，撤销跃进公社，恢复云仙区。
1969年，改云仙公社。
1981年12月，恢复思茅县建制，为思茅县云仙公社。
1984年，改云仙区。
1987年12月，改云仙乡。
1993年3月18日，改云仙彝族乡。
2006年3月18日，云仙、震东2乡合并为翠云区云仙彝族乡。
2007年，改思茅区云仙彝族乡。