清代以前部分居民点已建村。
1737年归属丽江府吉尾山后约，清晚期属丽江县山后里。
1912年归属兰坪州西新化里，1922年属第二区西新化里，时有长涧村。
1924年推行区、乡镇自治，划归第一区喇井乡（后改其名为聚宝乡），为闾、邻建制。
1939改为保甲制。
1941年全面推行乡镇保甲建制，长涧、高梧、温井、厂上、骡子箐、上五场、落坐村7个村划编为喇井镇第四保，桃树坪归属啦井镇第八保，直至解放初。
1953年划区乡政权时，以喇井镇第四保和第八保之桃树坪为区域成立兰坪县第一区拉井片长涧乡，乡政权驻长涧村。
1958年下半年公社化时期属啦井人民公社长涧管理区，基本以村为单元组建生产队，1961年划归19个人民公社之一的啦井人民公社，为长涧管理区。
1962年4月设立第一区啦井片长涧公社，1967年11月，划编为啦井区革命委员会长涧人民公社。
1969年1月更名为啦井公社革命委员会长涧大队。
1984年2月设区建乡，成立啦井区长涧乡人民政府。
1987年12月撤销区的建制，实行乡镇制，设立啦井镇长涧办事处，原生产队改称生产合作社。
2000年12月“村改委”时改长涧村民委员会，下辖13个自然村、编为13个村民小组，自得名沿用至今。