2001年4月得名。
解放初属北衙区，1951年至1957年属鹤庆县第五行政区，1958年为北衙区芹河乡，1960年3月，北衙、炉坪、西园、芹河4个乡成立北衙公社；西邑、响水河、七坪、水井、奇峰5个乡成立七坪公社；为北衙公社芹河管理区，1963年又将北衙、七坪两个公社合并，为北衙区芹河人民公社。
1967年改属为前进区，1970年撤区改社为前进公社芹河大队，1978年复名北衙公社，为北衙公社芹河大队。
1984年撤社改区，大队改为乡，为北衙区芹河乡。
1988年全县开展区乡体制改革，撤区建乡，原小乡改为村公所，为北衙乡芹河村公所。
2001年4月，经云南省人民政府批准，北衙撤乡置镇，撤销北衙乡，设立西邑镇，镇政府驻地由北衙村迁至西邑村。
撤乡设镇后，西邑镇管辖原北衙乡管辖的行政区划，隶属关系不变，所属村民委员会不变，为西邑镇芹河村民委员会，名称沿用至今。