清属东川府集义乡，民国属会泽县集义镇碧谷乡，1952年属会泽县新村区碧谷乡，1956年属东川市新村区碧谷乡，1958年属东川市，1959年属碧谷人民公社，1962年属中甸人民公社，1965年属碧谷人民公社，设李子沟大队，1984年5月，改为李子沟彝族乡，属碧谷区公所，1988年1月，设村公所，属碧谷镇，2000年改为李子沟村民委员会属碧谷镇，2005年乡镇合并改为铜都镇李子沟村民委员会，2011年改为铜都街道李子沟村民委员会。
2019年12月铜都街道办事处分别析置为铜都街道办事处和碧谷街道办事处，李子沟村民委员会自此隶属碧谷街道。