1952年1月至1958年8月为菩船乡一大队；1958年9月成立菩船人民公社管理委员会，菩船村为菩船人民公社管理委员会一大队；1966年12月，菩船人民公社管理委员会更名为双流人民公社管理委员会，菩船村为双流人民公社管理委员会一大队；1984年改双流人民公社管理委员会为双流乡人民政府，改菩船一大队为菩船村；2005年3月，乡镇行政区划调整时，菩船乡整乡并入双流乡，2016年8月，乡改镇；2020年撤销笔山村，并入菩船村，菩船村名一直沿用至今。