清朝初年，枣园堡隶属于河合里，道光七年（1827年），枣园堡归宜禄南乡大村管辖，村名为枣园堡。
民国改元后，归宜禄里十甲管辖，村名为枣园村。
民国后期又归宜禄乡公所和朱成乡公所管辖。
解放初，归宜禄区田惠乡管辖，1956年，撤区并乡，归枣园乡管辖，枣园村成为枣园地区的政治、经济、文化活动中心。
1958年，枣园村归县长武人民公社枣园生产管理区管辖，1961年，恢复长武县置后，归枣园人民公社管辖，改名为枣园生产大队。
1984年，政社分设，成立枣园村村民委员会，归枣园乡人民政府管辖。
2011年底，撤乡并镇，归枣园镇人民政府管辖至今。