解放前，白河县划归湖北省郧县，隶属中厂三吕。
1949年解放后，划入白河县辖区管理。
1951年，三院、花湾、新庄和荆竹4个互助组均属二区大双乡；新红互助组属二区秧田乡。
1954年，三院、花湾、新庄和荆竹4个互助组分别转为高级社，均属二区大双乡；新红互助组转为高级社，属二区秧田乡。
1956年，三院、花湾、新庄、荆竹和新红5个高级社均属冷水区大双乡。
1958年，三院、花湾、新庄、荆竹和新红5个高级社分别转为大队，均属冷水公社大双管区。
1962年，三院、花湾、新庄、荆竹和新红5个大队均属冷水区大双公社。
1984年5月，三院、花湾、新庄、荆竹和新红5个大队均属冷水区大双乡。
1996年11月，三院、花湾、新庄、荆竹和新红5个大队分别变更为三院、花湾、新庄、荆竹和新红5个村村民委员会，属大双乡。
2000年8月，撤销新红村村民委员会，将其辖区并入三院村村民委员会；撤销新庄村民委员会，将其其辖区并入荆竹村村民委员会。
2004年2月，撤销荆竹村村民委员会，将其辖区并入花湾村村民委员会，同时，将原花湾村3、5、6组并入三院村村民委员会；将三院村老新红片划入兴隆村村民委员会。
2011年5月，三院村村民委员会属冷水镇。
2014年，将花湾村一组并入三院村村民委员会。
2017年9月，三院村村民委员会变更为三院社区村民委员会，属冷水镇至今。