垦利域地，由西汉（公元前206～公元25年）以后黄河淤积退海而成。
区域西半部，元末明初已有居户，大部分村落建于明、清两代。
区域东半部，20世纪初始有人烟，大部分村落形成于30年代，有的村庄则在40年代解放后始成。
1941年9月，垦区抗日民主政权建立，为建置之始。
1943年，垦区正式称垦利县,因县域曾被称作垦区和利津洼而得此名。
之后，行政区划变动频繁。
2010年，垦利区辖胜坨、郝家、永安、黄河口、董集5个镇和垦利、兴隆2个街道办事处，1个省级经济开发区，有333个村民委员会。