明洪武二十四年（1391年）4月，朱元璋十五子庆王命在此采煤，供王府使用，同时烧制瓷器，始有磁（瓷）窑寨。
[14]解放以后，宁东为新华第二煤矿。
1952年，改名叫磁窑堡煤矿。
1961年9月，由燎原人民公社析出磁窑堡人民公社。
1983年6月，撤销人民公社设磁窑堡乡。
1985年12月，撤销磁窑堡乡设磁窑堡镇。
2004年10月，镇政府机关由磁窑堡迁至马跑泉村黎家新庄（习惯称中心区）。
[14]2005年8月18日，灵武市磁窑堡镇正式更名为宁东镇。
2011年，宁东镇整建制划归自治区宁东基地管委会代管。