据《奉天通志》记载：样子哨镇在远古时期就有劳动人民生活并开始了农耕。
清代初期，这里被封禁为盛京围场。
1902盛京围场全部开禁，逐渐形成居落。
1926经奉天省决定把柳河县的六区、七区和通化县的新民、安衡、永衡、庆升4村划出，成立金川县，隶属奉天省管辖，本镇属之。
1932成立伪金川县公署，样子哨街为伪金川县公署驻地。
中华民国22年、1933撤销街村制，样子哨镇为第一区样子哨村。
中华民国26年、1937金川县划归通化省管辖。
1941年7月1日，伪金川县撤销，将其所辖的小金川村、板石河村、大椅山村、样子哨街划入辉南县。
1945年11月，辉南县民主联合政府成立后，把全县划为8个区，为三区（样子哨区）。
1949年，三区划出样子哨镇内及解放、永安、辛家街、保安、东胜、西胜、陈家街等街村成立样子哨镇。
1958年9月，人民公社化中，由原样子哨镇的3个高级社和工商户组成红光人民公社，辖永康、团林子、兴安、小城子、头道沟、育民6个管理区，52个生产队。
1961年，全县人民公社调整，红光人民公社改为样子哨镇人民公社。
1964年，增建河北大队，达到6个生产大队。
1965年，样子哨镇人民公社分为样子哨镇人民公社和样子哨人民公社，样子哨镇人民公社。
1982年，全县调整生产大队和生产队，样子哨镇人民公社。
1983年，全县对人民公社体制进行改革，改为样子哨镇。
名称沿用至今。