商周时期相传属“扬州之域”。
春秋属吴、越。
战国属楚。
秦属鄣郡。
汉属丹阳郡歙县地。
三国吴属新都郡休阳县地。
晋属新安郡海阳（海宁）县地。
隋属歙州休宁县地。
唐开元二十八年（740）正月初八，析休宁县回玉乡和乐平县怀金乡，纵横二百余里，立婺源县，治设清华，隶属歙州。
天复元年（901），县治由清华迁移至弦高镇（今蚺城街道）。
宋宣和三年（1121），隶属徽州。
元属徽州路。
元贞元年（1295），升为婺源州。
明属徽州府。
明洪武二年（1369），降州为县。
清仍明制，废府留县，1912年，婺源县直隶安徽省。
1914年属芜湖道。
1932年属安徽省第十行政区。
1934年划属江西省，次年属江西省第五行政区。
1947年属安徽省第七行政区。
1949年5月复属江西省，属华东区赣东北行政区浮梁县专区，同年9月改属江西省乐平专区，11月重属江西省浮梁专区。
1952年10月，划归江西省上饶专区。
1970年属上饶地区。
2000年6月属上饶市至今。