清朝光绪二十九年（1903年），现大阿镇区域时设柳枝、厚塘、十里3个堡。
中华民国二十八年（1939年）7月，改联保为乡镇，设大阿区，辖大阿等乡。
1949年8月，设大阿、禾秋、阿南、禾西、川风、芫峰、莲塘7个乡，设大阿区辖大阿等16个乡；1956年5月，大阿等7个乡并为大阿、禾秋2个乡；1957年4月，恢复大阿区，辖大阿、禾秋等5个乡；1958年9月，原大阿、禾秋、长安、黄泥4个乡组建大阿公社；1961年10月，大阿公社分设为大阿、禾秋、黄泥3个公社，隶属大阿区；1962年5月，禾秋公社并入大阿公社；1968年10月，黄泥公社并入大阿公社；1972年10月，又分设黄泥公社；1984年6月，大阿公社改制为大阿乡；1988年12月10日，大阿撤乡设镇。