芳园村由原芳园村与狮寨村合并而成。
芳园原名长教。
中华人民共和国成立前长教、狮寨分别为高兰乡长教保第四、第一甲；中华人民共和国成立初设长教乡，狮寨与横坑尾合并成长教乡的一个村；1956年长教分为长兴、长教、长峰初级社，狮寨亦为初级社；1957年长兴、长新、长峰合并为长峰高级社，狮寨亦转为高级社；1958年长峰改为长教大队，狮寨改为东红大队，均属珠兰乡；1959年长教、东红合并为龙车作业区；1960年分开，分设长教大队、东红大队；1968年长教、东红合并为长教大队；1978年冬东红大队改为狮寨大队从长教大队分出，分设两个大队；因与洞头公社长教大队重名，于1983年更名为芳园大队；1984年撤社建乡时设芳园村、狮寨村，均属珠兰乡；2003年芳园村与狮寨村合并为狮寨村；2007年狮寨村更名为芳园村属珠兰乡至今。