1948年8月属信随县祝林区。
1949年2月属河南省信阳县祝林区。
1949年11月属随县祝林区。
随后，实行区管小乡制，分别为祝林乡、大善乡和罐子沟乡，属祝林区。
1956年3月属殷店区祝林乡。
1958年9月成立人民公社，分别命名为灯塔大队、大山大队和森林大队，属灯塔（草店）公社祝林管理区。
1959年1月属殷店公社。
1960年12月复属草店公社祝林管理区。
1961年6月属草店区祝林公社。
1975年9月属小林公社祝林管理区。
1981年地名普查时，灯塔大队、大山大队分别更名为祝林店大队和大善寺大队，森林大队不变，属小林公社祝林管理区。
1984年设区建乡、撤队改村，祝林店大队、大善寺大队和森林大队分别更名为祝林店村、大善寺村和粉坊村，其中大善寺村属小林镇，祝林店村和粉坊村属淮河区祝林乡。
1987年9月，属小林镇。
2004年10月三村合并为祝林店村，属小林镇至今。