唐宋时，外迁移民在此开荒耕种，繁衍生息；明清时期，建立地方保甲，设立地方基层政权组织，查户籍教化，催祖赋役；清光绪7年（1881年）为加强统治，兴办民团，设立白鸡乡，穿山堰归白鸡乡辖；后组织军民相间的民团组织，改保甲乡里为团，实行联保甲制。
设穿山甲，归五区所辖；民国24年（1935年）改穿山堰保；民国25年（1936年）归五区（土城）白鸡乡所辖。
解放后，1951年设立穿山堰生产大队归白鸡铺辖；1975年3月隶属于土城公社；1984年6月设立穿山堰村民委员会；2002年合组并村，将穿山堰村与四棵树村合并为穿山堰村委会，归土城镇辖。