明成化十二年（1946），皋南（九店）、九皋2保6里划给伊阳县（今汝阳县）。
清光绪三十二年（1906），属和乐里温泉保。
1941年属温泉乡。
1947年解放属黄庄区。
1948年从黄庄区划出东北部成立九点区，同年10月又并入黄庄区。
1951年复建九店区（第八区）。
1958年归黄庄人民公社。
1961年成立九店公社（归原黄庄区)。
1963年九店、王楼、饭坡3个小公社合并为九店人民公社。
1975年将汪城、张园、饭坡、时坪、禹山、青山、赵庄7个大队划归饭坡公社。
1984年改为九店乡。
2018年撤乡设镇，为九皋镇，沿用至今。