历史上，先后隶属于南海郡番禺发（秦）、博罗县（汉三国）、宝安县（东晋咸和6年至唐至德二年）、东莞县（宋开宝五年，东莞县并入增城县，本村属增城县，宋开宝六年1973年复置东莞县至明万历元年）、新安县（万历元年1573年，析东莞县，置新安县，明万历元年至清康熙五年）、东莞县（清康熙五年至清末）、宝安县（民国3年、1914年至中华人民共和国成立前）。
1949年10月至1951年属惠阳县第四区；1951年至1957年属第七区；1957年至1958年属惠阳县大鹏乡；1958年3月至1983年属宝安县大鹏公社；1983年7月至1986年10月属宝安县大鹏区；1986年10月至1993年1月属宝安县南澳镇；1993年1月至今属深圳市龙岗区南澳镇。
2004年9月，“东渔村民委员会”更名为“东渔社区居民委员会”，名称沿用至今。