清雍正年间，现五墩村三组、四组从该省渭源县迁入移民，称下渭源坊。
现五墩村1949年前属二乡一保。
1949年后为二区一乡二行政；1955年成立五墩初级社；1957年转为高级社；1958年为敦煌人民公社三危大队五墩生产队；1961年为五墩公社五墩大队；1966年更名为向阳大队；1969年恢复为五墩大队；1983年3月撤大队设村；2005年靖远村撤村并入五墩村，五墩村村名沿用至今。
靖远村因清雍正年间移民多数来自我省靖远县而得名。
1955年成立了两个初级社（一、二、三队为红星社，四、五队为黎明社）。
1957年合并为靖远高级社。
1958年为敦煌人民公社三危大队五墩中队靖远生产队。
1961年为五墩公社靖远大队。
1966年更名为曙光大队。
1969年恢复为靖远大队。
1983年撤大队合村。
2007年撤村并入五墩村。
现已消失。