原先的思南居委会在1958年前属思明办事处管，1958年划给文安办事处，1966年改为红卫居委会，1980年1月10日恢复旧称为思南居委会。
思南居委会2002年2月合并虎头山居委会，管辖范围东至九族巷，西至海军码头，南至37514部队办公楼，北至镇海路十字路口、面线巷，思南居委会改称为思南社区居委会，办公地点为面线巷15号。
2003年6月由原思南社区居委会、金新河社区居委会、石坊社区居委会部分整合而成。
思南社区居委会办公地点设在通奉第横巷28号。